След близо три години и половина пътищата на Берое и Петър Хубчев се разделиха.

Петър Хубчев пое отбора на 18 октомври 2012 г., след като бе спортно-технически директор на клуба от февруари същата година.

За този период той бе начело на тима в 144 мача във всички турнири. В тях е постигнал 71 победи, 39 равенства и 34 загуби.

Като старши треньор на Берое Петър Хубчев спечели сребърните медали през сезон 2014/15 г., както и Купата и Суперкупата на България през 2013 г.

Берое участва и на два пъти в турнира Лига Европа под ръководството на Петър Хубчев.

Петър Хубчев е един от най-дълго задържалите се треньори начело на отбор в А група в съвременната история на българското първенство.