Сантини води петлите от 2002 до 2004 година, като бе уволнен от поста, след като загуби от Гърция на четвъртфиналите на Евро 2004 в Португалия.
След като напусна националния на Франция, специалистът води Тотнъм за само пет месеца, а през сезон 2005/06 води Оксер, където замени легендата Ги Ру.
Преди да поеме петлите, той постави основите на шампионския отбор на Лион, който от 2002 година насам е неизменен шампион на Франция.