Мерида е роден в Барселона и от 8-годишна възраст тренира в школата на тима. През 2005 година той премина в Арсенал, а пред 2007-а направи дебют за първия отбор.
Фран Мерида бе част от испанския национален отбор за юноши до 17 години, който спечели европейската титла през 2007 година.
